ну потому что куда ему теперь? ФБРовцы в покое уже не оставят, раз уж он рот открыл. очевидно, что он много знает, его будут трясти как грушу беспрестанно.
среди своих он тоже все потерял, нарушив омерту - был главой семейства, пусть небольшого, а стал стукачом. в тюрьме бы ему несладко пришлось. потому что поступил не по понятиям, надо было шумиху переждать и между собой разобраться, а он в полицию побежал.
а главное - Майклу он теперь не нужен. сломавшийся, потерявший уважение человек будет постоянной угрозой - тебе же еще в первом фильме объяснили, что предателей прощать нельзя, потому что они сами себе не прощают и всегда могут предать повторно. Майкл поставит кого-нибудь нового управлять в Нью-Йорке. поэтому Корлеоне нужна его жизнь, не меньше - и для безопасности, и для примера остальным. ну а ему самому в такой ситуации жизнь не очень нужна.